売ることは可能ですが、ローンについている抵当権を引き渡し前に抹消することが条件になることが多いです。
一般には、もらった手付金や内金でローンの残額を完済し、引き渡しまでに抵当権の抹消を行います。
手持金や内金で、ローンを完済できない場合は、売買代金の最終決済のときまでに、抵当権抹消登記に必要な書類を用意しておき、受け取った代金でローン残高を決済し抹消登記に必要な書類を買主に渡し、同時に所有権移転登記に必要な書類を買主に渡す、ということになります。